公衛體檢系統在實際應用中可能會遇到多種問題，這些問題涵蓋了技術、數據、服務和管理等多個方面。以下是一些常見的問題：
1、數據采集整合問題：公衛體檢涉及的項目眾多，各種體檢數據整理起來并不容易。特別是一些設備對應的軟件系統可能沒有數據導出功能，導致數據采集和整理存在較大的困難。
2、系統間數據不通：體檢車內的軟件系統與公衛平臺可能是兩個相對獨立的系統，由不同的軟件廠商開發，導致體檢數據相互獨立，無法同步到公衛平臺。
3、開放接口難度大：為了解決系統間數據不通的問題，需要開放接口進行數據傳輸。然而，這需要在雙方軟件廠商協調一致的情況下執行，可能會因為價格談不攏、聯系不上等原因而難以實現。
4、人工上傳數據效率低：在數據無法自動傳輸的情況下，人工錄入成為主要的解決方案。但手動將采集到的體檢數據一條一條地復制粘貼到公衛平臺，不僅工作量大，而且容易出錯。
5、資源整合難度大：實現一站式體檢需要整合多個科室和部門的專業資源，對醫療機構的硬件設施、人力資源及運營管理提出了更高的要求。如何有效配置并合理利用這些資源，避免重復建設和浪費，是醫療機構面臨的一大挑戰。
6、服務質量把控難：由于體檢項目的多樣性、復雜性以及涉及人員眾多等因素，可能導致體檢質量難以保證。如何確保每個體檢環節的標準操作和質量控制，減少人為差錯和漏檢情況的發生，成為一站式體檢服務亟待解決的問題。
7、覆蓋范圍有限：盡管公共衛生體檢應該面向所有的公民，但由于資源有限，目前只有部分人群能夠獲得免費或補貼的體檢服務。這導致一些經濟困難或偏遠地區的人群無法享受到相應的健康檢查。
8、體檢內容不夠全面和科學：當前的公共衛生體檢主要側重于常見疾病的篩查，而對一些潛在的、不易被察覺的健康問題往往忽視或沒有相應的檢查項目。例如，精神健康、營養狀況和生活方式等方面的評估在體檢中常常被忽略。
為了解決這些問題，公衛體檢系統需要不斷進行技術更新和優化，同時加強與其他醫療系統的協作和整合。此外，還需要加強政策支持和資金投入，提高體檢服務的覆蓋范圍和質量。
