公共衛生體檢一體機專家指出菇菌類屬于低脂肪、高纖維及高蛋白質的食材，含有豐富多醣體、硒質、鉀質、水溶性纖維及維他命B及C等。
多醣體能刺激人體免疫系統細胞，增強免疫力，硒質可助抗氧化，保護細胞健康。不過，菇菌是否有抗癌及抗衰老功效，則有待更多研究證實。
菇菌的鉀質相當豐富，一百克秀珍菇已含逾四百毫克鉀質，比香蕉的鉀含量更多。公共衛生體檢一體機專家指出鉀質有助平衡體內鈉質水平，維持血壓健康。菇菌中還含有植物固醇，有助于調節肝臟制造的膽固醇量，降低體內膽固醇，因此菇菌是大人及小朋友的護心營養食物之選。
吃菇菌亦是攝取膳食纖維的有效方法，以草菇為例，一碗草菇的纖維量約四點五克，與一碗煮熟的糙米飯纖維量相當。雖然菇菌好處多，但大家常會擔心它所含的「普林」，容易引致痛風癥。
公共衛生體檢一體機專家指出普林在體內轉化成尿酸后，如未能有效排走及積聚，會令血液尿酸水平升高，增加痛風癥病發機會。其實菇菌的普林值與魚肉及雞肉相若，但遠低于豬骨、內臟、蝦及蟹，飲水不足者才易有尿酸未能有效排走情況，只要日常的飲食均衡，不過量進食菇菌，保持正常的飲水量，已可以防患痛風癥。
